Bu çalışma, bir flavonoid olan eupatorin’in, diyabetik ayak ülseri gibi kronik inflamatuar ayak hastalıklarında görev alan İnsan nötrofil elastazı (HNE) üzerindeki inhibitör etkisini araştırmayı amaçlamaktadır.Gereç ve Yöntem: Eupatorin’in HNE ile olası bağlanma etkileşimleri, AutoDock Vina ile yürütülen moleküler yerleştirme simülasyonları ile incelenmiştir. Ardından, 100 nanosaniyelik moleküler dinamik simülasyonlar ve MM/GBSA bağlanma serbest enerjisi analizleri gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Moleküler yerleştirme analizleri eupatorin’in HNE’ye –7,9 kcal/mol bağlanma afinitesi ile bağlandığını göstermiştir. Dinamik simülasyonlar, ligandın konumunu bağlanma cebinde koruduğunu ve 0–3 arasında değişen, ortalama 1 hidrojen bağı içeren bir etkileşim örüntüsü sergilediğini ortaya koymuştur. SASA değerleri, ligandın çözücüye açık, yarı gömülü bir cepte yer aldığını göstermektedir. MM/GBSA analizleri ise bağlanmanın enerjetik olarak elverişli olduğunu desteklemiştir
Bu bulgular, eupatorin’in HNE ile tersinir ve kovalent olmayan bir etkileşim örüntüsü kurabileceğini düşündürmektedir. Eupatorin, HNE ile ilişkili inflamatuar süreçlerin modülasyonu için deneysel olarak değerlendirilmesi gereken umut vadeden doğal bir yapı iskelesi olarak değerlendirilebilir.